Bei uns ist es auch an der Tagesordnung, dass Differenzierungen wegen Vertretungen aufgelöst werden. Das ist für die Betroffenen zwar ärgerlich, aber noch schlimmer wäre es, wenn alle Vertretungen mit Überstunden gestemmt werden müssten. Im Mittelschulbereich werden diese nämlich leider nicht erfasst und dementsprechend auch nicht vergütet.
Da immer nur du statt des Kollegen aus der Differenzierung genommen wirst, gehe ich davon aus, dass deine Stunde als Diff im Stundenplan steht und seine als reguläres Fach. Somit wäre dieses Vorgehen ganz normal.
Aufgrund deiner zahlreichen Differenzierungsstunden vermute ich, dass du im 1. Jahr der Sondermaßnahme bist. Im 2. Jahr ist Klassleitung Pflicht und es besteht wesentlich weniger Gefahr, aus deinem Unterricht abgezogen zu werden. Dieses Schuljahr musst du nur noch 4 Wochen durchhalten, dann sind auch in Bayern Sommerferien.